Orální mikrobiota je komplexní ekosystém mikroorganismů, které se nacházejí v ústech. Tento mikrobiální ekosystém zahrnuje různé druhy bakterií, virů a hub, které jsou nezbytné pro udržení zdraví ústní dutiny. Orální mikrobiota má důležitou roli při udržování rovnováhy v ústech a pomáhá chránit ústní dutinu před škodlivými mikroorganismy.

Hlavní funkcí orální mikrobioty je udržování správné hladiny pH v dutině ústní, což je důležité pro ochranu zubů a dásní před kyselinami a tvorbou zubního kazu. Kromě toho, orální mikrobiota pomáhá s trávením potravy a tvorbou slin, která obsahuje enzymy k rozkladu potravy a pomáhá chránit ústní dutinu před infekcemi.

Střevní mikrobiota je jednoznačně nejznámější a nejrozsáhlejší část naší mikroflóry. V našem střevě je přibližně stejný počet bakterií jako buněk v celém našem těle, což představuje hmotnost asi 300 gramů mikroorganismů. Tyto mikroorganismy tvoří naši střevní mikroflóru.

Střevní mikroflóra vykonává ochrannou funkci proti infekcím prostřednictvím bariérových mechanismů a blokování zdrojů. Vyvážený růst prospěšných složek mikrobioty vytváří konkurenční tlak na oportunní bakterie, které se nebudou moci množit.

Mikrobiota je přítomna v celém našem trávicím traktu. Na začátku je její množství menší kvůli přítomnosti žlučových solí, ale její rozmanitost a komplexnost dosahují vrcholu v tlustém střevě, které je považováno za jedno z míst na planetě s největším počtem mikroorganismů.